Diese Liste von sequenzierten Genomen umfasst Genome der Eukaryoten - Lebewesen mit - und Prokaryoten - Lebewesen ohne Zellkern - als auch ihrer Viren, deren Genom vollständig sequenziert wurden.
Das kleine zirkuläre und einzelsträngige DNS-Genom (sscccDNA) des φX174 Bakteriophagen von nur wenigen tausend Nukleotiden (5386 Basenpaare, bp) wurde erstmals 1977 von Frederick Sanger sequenziert, welches bedeutet, dass seine Nukleotidsequenz mit Hilfe von Sanger-DNS-Sequenzierung erstmalig vollständig ermittelt werden konnte. Nach und nach wurde die DNS von ganzen Chromosomen und Genomen komplexer Lebewesen sequenziert. Die erste Sequenzierung des vollständigen Genoms eines Lebewesens gelang 1995 mit dem Bakterium Haemophilus influenzae. Die so ermittelten Basensequenzen werden über das Internet, unter anderem vom NCBI, bereitgestellt.
1996 wurde mit der Backhefe (Saccharomyces cerevisiae), die zu den Pilzen gehört, das erste Genom eines Eukaryonten veröffentlicht und 1998 wurde mit dem zu den Tieren gehörenden Fadenwurm Caenorhabditis elegans das erste Genom eines Mehrzellers veröffentlicht.
Die Forschung konzentrierte sich zunächst auf die Sequenzierung von Organismen, die entweder für die Grundlagenforschung oder die für die anwendungsorientierte, medizinisch-pharmazeutische Forschung von besonderem Interesse sind. Solche eukariontische Organismen sind in dieser Liste zu finden. Mit dem Fortschritt der Technik wurde die Sequenzierung immer schneller, einfacher und somit auch günstiger, so dass inzwischen das Genom von über 50.000 (Stand: 2020) verschiedenen Organismen analysiert werden konnte.
Die Sequenz von Genen und Genomen kann genutzt werden um Konservierung dieser festzustellen und basierend darauf die physiologischen Wichtigkeit einiger Gene und deren RNSn und Proteinen als auch relative Alter der Gene und somit der Spezies zu klären.
Eukaryonten
Die Genome eukaryotisches Lebens sind für human-zentrierte Forschung besonders notwendig, da der Mensch selber Teil dieser Domäne ist.
Unikonta
Fungi - Pilze
Aufgelistet sind die fünf Pilze, deren Genom zuerst sequenziert wurde.
| Organismus | Typ | Relevanz | Größe des Genoms | vorhergesagte Anzahl von Genen | Organisation | Jahr der Sequenzierung | Bild |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Saccharomyces cerevisiae Strain:S288C | Backhefe | Backhefe; Modellorganismus Eukaryont | 12.1 Mb | 6 294 | International Collaboration for the Yeast Genome Sequencing | 1996 | |
| Encephalitozoon cuniculi | Microsporidium | Humanpathogen | 2.9 Mb | 1 997 | Genoscope und Université Blaise Pascal | 2001 | |
| Schizosaccharomyces pombe Strain:972h- | Spalthefen | Modellorganismus Eukaryont | 14 Mb | 4 824 | Sanger Institute und Cold Spring Harbor Laboratory | 2002 | |
| Neurospora crassa | Sordariomycetes | Modellorganismus Eukaryont | 40 Mb | 10 082 | Broad Institute, Oregon Health, Science University, University of Kentucky und die University of Kansas | 2003 | |
| Phanerochaete chrysosporium Strain:RP78 | Stielporlingsartiger | Holzpilz für Verrottung, wird für Bioremediation verwendet | 30 Mb | 11 777 | Joint Genome Institute | 2004 |
Animalia - Tiere
Aufgelistet sind die vier Tiere, deren Genom zuerst sequenziert wurde. Außerdem sind Säugetiere, deren Genom vor 2010 sequenziert wurde und weitere wichtige Modellorganismen in die Liste aufgenommen.
| Organismus | Typ | Relevanz | Größe des Genoms | vorhergesagte Anzahl von Genen | Organisation / Bemerkung | Jahr der Sequenzierung | Bild |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Caenorhabditis elegans Strain:Bristol N2 | Nematode | Modellorganismus Tier | 100 Mb | 19 000 | Washington University und das Sanger Institute | 1998 | |
| Drosophila melanogaster | Fruchtfliege | Modellorganismus Tier | 165 Mb | 13 600 | Celera, UC Berkeley, Baylor College of Medicine, European DGP | 2000 | |
| Homo sapiens | Primaten | Mensch | 3.2 Gb | 18 826 (CCDS consortium) | Human Genome Project Consortium und Celera Genomics | Entwurf 2001 Vollständig 2006 | |
| Anopheles gambiae Strain: PEST | Stechmücke | Verbreitung von Malaria | 278 Mb | 13 683 | Celera Genomics und Genoscope | 2002 | |
| Takifugu rubripes | Kugelfisch | Wirbeltier mit kleinem Genom, japanischer Kugelfisch | 390 Mb | 22 000 – 29 000 | International Fugu Genome Consortium | 2002 | |
| Mus musculus Strain: C57BL/6J | Nagetiere | Hausmaus | ca. 3 Gb | 24 000 | 2002 | ||
| Rattus norvegicus | Nagetiere | Wanderratte | 2.8 Gb | Entwurf 2004 | |||
| Pan troglodytes | Primaten | Schimpanse | 3.3 Gb | 2005 | |||
| Canis familiaris | Canidae | Haushund | 2.5 Gb | 19 300 | 2005 | ||
| Ornithorhynchus anatinus | Säugetier | Schnabeltier | 1.9 Gb | 18 600 | Entwurf 2007, vollständig 2021 | ||
| Monodelphis domestica | Beuteltiere | Haus-Spitzmausbeutelratte | 18 000–20 000 Gene | MIT und Harvard | 2007 | ||
| Macaca mulatta | Primaten | Rhesusaffe | 3.1 Gb | 30 000 | 2007 | ||
| Felis catus | Felidae | Hauskatze | 2.7 Gb | 20 000 | 2007 | ||
| Wollhaarmammut | Elephantidae | Erste Sequenzierung des Genoms einer ausgestorbenen Tierart. | > 4Gb | 2008 rund 70 Prozent der Erbinformation entschlüsselt, 2015 komplettes Genom | 2008 | ||
| Loxodonta africana | Elephantidae | Afrikanischer Elefant | 2009 | ||||
| Equus caballus | Unpaarhufer | Hauspferd | 2.5 Gb | 2009 | |||
| Bos primigenius taurus | Paarhufer | Hausrind | 2.7 Gb | 22 000. | National Institutes of Health und das US Department of Agriculture | 2009 | |
| Danio rerio | Cypriniformes | Zebrafisch, Modellorganismus Tier | 1.5 Gb | 26 000 | 2013 | ||
| Xenopus laevis | Anura | Krallenfrosch, historischer Modellorganismus für embryonale Entwicklung | 2.7 Gb | 44 456 | 2021 |
Archaeplastida
Plantae - Pflanzen
Aufgelistet sind die drei Pflanzen, deren Genome zuerst sequenziert wurden.
| Organism | Typ | Relevanz | Größe des Genoms | Anzahl Chromosomen | vorhergesagte Anzahl von Genen | Organisation | Jahr der Sequenzierung | Bild |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arabidopsis thaliana Ecotype:Columbia | Kreuzblütlerartige, Acker-Schmalwand | Modellorganismus, Unkraut | 135 Mb | 5 | 25 498, | Arabidopsis Genome Initiative | 2000 | |
| Oryza sativa ssp indica | Süßgrasartige, Reis | Feldfrucht und Modellorganismus | 420 Mb | 12 | 32 000–50 000 | Beijing Genomics Institute, Zhejiang University und Chinese Academy of Sciences | 2002 | |
| Westliche Balsam-Pappel | Malpighienartige, Pappel | Kohlenstoffsenke, Modellorganismus Baum, Nutz-Holzart und Vergleich mit A. thaliana | 550 Mb | 19 | 45 555 | The International Poplar Genome Consortium | 2006 |
Archaeplastida Algen
Aufgelistet sind die beiden archaeplastida Algen, deren Genome zuerst sequenziert wurden.
| Organism | Typ | Relevanz | Größe des Genoms | Anzahl Chromosomen | vorhergesagte Anzahl von Genen | Organisation | Jahr der Sequenzierung | Bild |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cyanidioschyzon merolae Strain:10D | Rotalge | einfacher Eukaryont | 16.5 Mb | 20 | 5 331 | University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University und Kumamoto University | 2004 | |
| Ostreococcus tauri | Grünalge | einfacher Eukaryont, kleines Genom | 12.6 Mb | 20 | 7 969 (UniProt) | Laboratoire Arago | 2006 |
Protisten der SAR, Excavata und Pancryptista Kladden
Protisten sind eine historische Kladde hochdiverser eukaryotischer mono- (ein-) oder selten oligo- (wenig-)zellulärer Spezies aus verschiedenen modernen Reichen. Die moderne Taxonomie beruht auf genetischem Konservatismus, welches hauptsächlich durch Genom-Sequenzierung ermöglicht wurde. Mitunter aufgrund der Abstammung des multizellulären Lebens von dieser Kladde ist das Verständnis protistischer Genome notwendig, sowohl zur evolutionsbiologischen Aufklärung als auch zur Feststellung von Konservation spezifischer Nukleotidsequenzen als auch biochemischer Funktionen.
Aufgelistet sind die neun nicht-archaeplastida Protisten, deren Genom zuerst sequenziert wurden.
| Organismus | Typ | Relevanz | Größe des Genoms | vorhergesagte Anzahl von Genen | Organisation | Jahr der Sequenzierung | Bild |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Guillardia theta | Cryptomonad | Modellorganismus | 551 kbp nucleomorph (nur das Genom) | 465 | Canadian Institute of Advanced Research, Philipps-University Marburg und die University of British Columbia | 2001 | |
| Plasmodium falciparum Clone:3D7 | Apicomplexa | Humanpathogen (Malaria) | 22.9 Mb | 5 268 | Malaria Genome Project Consortium | 2002 | |
| Plasmodium yoelii yoelii Strain:17XNL | Apicomplexa | Nagetier-Pathogen (Malaria) | 23.1 Mb | 5 878 | TIGR und NMRC | 2002 | |
| Cryptosporidium hominis Strain:TU502 | Apicomplexa | Humanpathogen (Durchfall) | 10.4 Mb | 3 994 | Virginia Commonwealth University | 2004 | |
| Cryptosporidium parvum C- or genotype 2 isolate | Apicomplexa | Humanpathogen (Durchfall) | 16.5 Mb | 3 807 | UCSF und University of Minnesota | 2004 | |
| Thalassiosira pseudonana Strain:CCMP 1335 | Diatom | Modellorganismus Kieselalge | 34.5 Mb | 11 242 | Joint Genome Institute und die University of Washington | 2004 | |
| Trypanosoma cruzi Strain:CL-Brener | Kinetoplastid | Humanpathogen (Chagas) | 67 Mb | 22 570 | The Institute for Genome Research (TIGR), Karolinska Institutet (KI) und Seattle Biomedical Research Institute (SBRI) | 2005 | |
| Trypanosoma brucei Clone:TREU 927/4 | Kinetoplastid | Humanpathogen (Schlafkrankheit) | 26 Mb | 9 068 | Wellcome Trust Sanger Institute und The Institute for Genome Research (TIGR) | 2005 | |
| Leishmania major Strain: Friedlin | Kinetoplastid | Humanpathogen (Orientbeule) | 32.8 Mb | 8 272 | Wellcome Trust Sanger Institute und Seattle Biomedical Research Institute (SBRI) | 2005 |
Prokaryota - Prokaryoten
Im Folgenden werden wichtige sequenzierte prokaryotische Genome, aufgespalten auf die beiden untergeordneten Domäne aufgelistet.
Bacteria - Bakterien
Im Folgenden werden wichtige sequenzierte Bakterien Genome aufgelistet.
| Spezies | Strang | Familie | Interesse | Chromosomengröße | Plasmide | Plasmidgröße | Protein-Sequenzen | Stand | Projekt |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Escherichia coli | K-12/MG1655 | Enterobacteriaceae | Modellorganismus gramnegativer Bakterien, Darmflora Mensch (Viele weitere Stränge sequenziert) | 4.6 Mb | 0 | / | 4300 | 2025 | E. coli Genome Project (GSGSC-UW) PRJNA57779 |
| Yersinia pestis | KIM10+ | Yersiniaceae (Ordnung: Enterobacterales) | Erreger der Pestilenz, größte pandemische Krankheit der festgehaltenen menschlichen Geschichte | 4.6 Mb | 1 | 101.0 kb (pMT-1) | 4205 | 2002 | GSGSC-UW NIH-Med |
| Salmonella Typhi | Ty2 | Enterobacterales | Erreger der Abdominaltyphus | 4.8 Mb | 0 | / | 2003 | GSGSC-UW | |
| Shigella flexneri 2a | 2457T | Enterobacteriaceae | Erreger der Dysenterie | 4.6 Mb | 0 | / | 4068 | 2003 | GSGSC-UW NIH-Med |
| Mycobacterium tuberculosis | HN-024/MG1655 | Mycobacteriaceae | 'Wichtigster' Erreger der Tuberkulose beim Menschen | 4.4 Mb | 0 | / | 4027 | 2017 | NIH-Med |
| Haemophilus influenzae | PittGG | Pasteurellaceae | Schleimhautflora Mensch & Krankheitserreger | 1.9 Mb | 0 | / | 1667 | 2007 | NIH-Med |
| Streptomyces coelicolor | A3(2) | Streptomycetaceae | Modellorganismus aus Bodenproben | 8.7 Mb | 2 | 356.0 kb (SCP1) 31.3 kb (SCP2) | 8154 | 2003 | NIH-Med |
| Helicobacter pylori | 26695 | Helicobacteraceae | Erreger einiger Magenerkrankungen des Menschen | 1.7 Mb | 0 | / | 1594 | 2012 | NIH-Med |
| "Aquifex aeolicus" | VF5 | Aquificaceae | Einer von nur wenigen bekannten Vertretern des Aquificota-Stammes | 1.6 Mb | 1 | 39.5 kb | 1553 | 2003 | NIH-Med |
| Thermotoga maritima | MSB8 | Thermotogaceae (Stamm: Thermotogota) | Einziges bekanntes fermentatives Bakterium, welches nutzbaren Wasserstoff über dem Thauer Limit freisetzt | 1.9 Mb | 0 | / | 1871 | 2013 | NIH-Med |
Archaea - Archaeen
Im Folgenden werden wichtige sequenzierte Archaeen Genome aufgelistet.
| Spezies | Strang | Familie | Interesse | Chromosomengröße | Plasmide | Plasmidgröße | Protein-Sequenzen | Stand | Projekt |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Methanocaldococcus jannaschii | DSM 2661 | Methanocaldococcaceae | Vermutlich erstes sequenziertes Archaeen-Genom | 1.7 Mb | 2 | 58.4 kb (pDSM2661_1) 16.6 kb (pDSM2661_2) | 1770 | 1996 | NIH-Med |
| Archaeoglobus fulgidus | DSM4304 | Archaeoglobaceae | früh sequenziertes Archaeum | 2.2 Mb | 0 | / | 2407 | 2003 (1997) | NIH-Med |
| Pyrococcus horikoshii | OT3 | Thermococcaceae | früh sequenziertes Archaeum | 1.7 Mb | 0 | / | 1857 Proteine vermutet (von 1943 Genen) | 1998 | NIH-Med |
| Aeropyrum pernix | K1 | Acidilobaceae (Klasse:Thermoprotei) | früh sequenziertes Archaeum | 1.7 Mb | 0 | / | 1704 Proteine vermutet (von 1763 Genen) | 1999 | NIH-Med |
| Pyrococcus furiosus | DSM 3638 | Thermococcaceae | früh sequenziertes Archaeum | 1.9 Mb | 0 | / | 2065 | 2001 (1999) | NIH-Med |
| Promethearchaeia archaeon | unk. | Lokiarchaeen s. s. (Promethearchaeaceae) | Loki-Asgard Archaeum, ehemals angenommen nächsten Verwandten zu Eukaryoten (jetzt nach Heimdallarchaeia) | 2.8 Mb | unk. | unk. | 2627 | 2025 | NIH-Med(MAG)NCBI-Tax |
| Candidatus Freyarchaeum deiterrae | unk. | Freyarchaeaceae | Asgard Archaeum, Evolutionsbiologisches Interesse | 3.8 Mb | unk. | unk. | 3272 | 2025 | NIH-Med(MAG)NCBI-Tax |
Siehe auch
- Humangenomprojekt
- GenBank
- Proteindatenbank
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